La base y estructura de la agencia será la que proporcionan tres centros de referencia, como son el Centro de Investigaciones Agrarias de Mabegondo (CIAM) en agroganadería, la Estación de Viticultura y Enología de Galicia (EVEGA) de Leiro en viticultura y enología y el Centro de formación y experimentación agroforestal de Lourizán en agroforestal.
La conselleira añadió que el presupuesto de esta agencia integrará todos los fondos de los programas relacionados en una sola dirección, con la suma de una importante aportación por parte del Plan de Desarrollo Rural Sostenible.