La junta directiva estará formada por el presidente, dos vicepresidentes, un tesorero y un secretario general, que también deberán ser ratificados de entre los 32 vocales.
Con posterioridad a la asamblea de la Inteprofesional, se reunirá el Pleno del Consejo Regulador de la Denominación de Origen Calificada "Rioja" para nombrar al nuevo presidente, que será el mismo que el de la nueva Interprofesional, ya que la junta directiva de esta organización económica se traslada al pleno del Consejo.
El nuevo mandato para los próximos cuatro años de la Interprofesional corresponde al sector productor y está previsto que lo inicie Luis Alberto Lecea, representante de ARAG-Asaja, que permanecerá en el cargo durante dos ejercicios, ya que el período restante lo completará un representante nombrado por la Federación Riojana de Cooperativas